Thẩm quyền giải quyết khiếu nại tại cơ quan thuế là yếu tố then chốt giúp người nộp thuế bảo vệ quyền lợi hợp pháp khi phát sinh tranh chấp với cơ quan thuế. Việc nắm rõ thẩm quyền giải quyết khiếu nại tại cơ quan thuế theo quy định của pháp luật hiện hành sẽ hỗ trợ cá nhân, tổ chức thực hiện quyền khiếu nại đúng trình tự, tránh mất thời gian và chi phí không cần thiết. Bài viết này phân tích chi tiết các quy định liên quan nhằm cung cấp thông tin hữu ích cho người đọc. Cùng ACC Hà Nội.

1. Thẩm quyền giải quyết khiếu nại tại cơ quan thuế theo quy định

Theo Luật Khiếu nại 2011, khiếu nại là việc cá nhân, tổ chức đề nghị cơ quan, tổ chức, cá nhân có thẩm quyền xem xét lại quyết định hành chính, hành vi hành chính khi có căn cứ cho rằng quyết định hoặc hành vi đó trái pháp luật, xâm phạm quyền, lợi ích hợp pháp của mình.

Trong lĩnh vực thuế, Luật Quản lý thuế 2025 quy định rõ thẩm quyền giải quyết khiếu nại thuộc về cơ quan thuế các cấp tùy theo tính chất và cấp độ của quyết định bị khiếu nại.

Cụ thể, cơ quan thuế đã ban hành quyết định hành chính về thuế có thẩm quyền giải quyết khiếu nại lần đầu. Nếu người khiếu nại không đồng ý với kết quả giải quyết, họ có quyền khiếu nại lần hai lên cơ quan thuế cấp trên trực tiếp.

Nghị định 254/2026/NĐ-CP bổ sung các quy định về thủ tục hành chính thuế liên quan đến hóa đơn, chứng từ, tạo cơ sở để xác định thẩm quyền giải quyết khiếu nại khi phát sinh tranh chấp về nghĩa vụ thuế.

Thẩm quyền này được phân định rõ ràng theo cấp hành chính nhằm đảm bảo tính khách quan, minh bạch và tuân thủ pháp luật trong quá trình giải quyết.

2. Thẩm quyền của cơ quan thuế cấp huyện và cấp tỉnh

Cơ quan thuế cấp huyện có thẩm quyền giải quyết khiếu nại đối với các quyết định hành chính do Cơ quan Thuế ban hành, bao gồm quyết định ấn định thuế, quyết định xử phạt vi phạm hành chính về thuế hoặc các quyết định liên quan đến đăng ký thuế.

Theo Luật Quản lý thuế 2025, Cơ quan Thuế phải tiếp nhận, xem xét và giải quyết khiếu nại trong thời hạn quy định, đồng thời thông báo kết quả cho người khiếu nại.

Khi người khiếu nại không đồng ý, hồ sơ được chuyển lên Cục Thuế cấp tỉnh để giải quyết lần hai. Cục Thuế cấp tỉnh có thẩm quyền giải quyết khiếu nại đối với quyết định do Cục Thuế ban hành và xem xét lại quyết định của Cơ quan Thuế cơ sở.

Luật Khiếu nại 2011 quy định rõ Cục Thuế phải tổ chức đối thoại với người khiếu nại trước khi ban hành quyết định giải quyết, đảm bảo quyền được trình bày ý kiến của các bên.

Nghị định 254/2026/NĐ-CP hỗ trợ bằng cách quy định chi tiết về các loại chứng từ điện tử, giúp cơ quan thuế cấp tỉnh xác minh nhanh chóng các sai sót liên quan đến hóa đơn khi giải quyết khiếu nại.

Xem thêm: Khiếu nại hàng hải là gì? Giải đáp

3. Thẩm quyền của Tổng cục Thuế và cơ quan cấp cao hơn

Tổng cục Thuế có thẩm quyền giải quyết khiếu nại lần hai đối với các quyết định hành chính do Cục Thuế ban hành hoặc khiếu nại lần hai đối với kết quả giải quyết của Cục Thuế.

Theo Luật Quản lý thuế 2025, Tổng cục Thuế chịu trách nhiệm kiểm tra, giám sát việc giải quyết khiếu nại của cơ quan thuế cấp dưới, đồng thời có quyền yêu cầu cơ quan thuế cấp dưới báo cáo và cung cấp hồ sơ liên quan.

Nếu người khiếu nại vẫn không đồng ý với quyết định của Tổng cục Thuế, họ có thể khởi kiện tại Tòa án theo quy định của Luật Khiếu nại 2011. Nghị định 254/2026/NĐ-CP quy định về quản lý hóa đơn điện tử, tạo điều kiện cho Tổng cục Thuế xác minh tính chính xác của dữ liệu thuế khi giải quyết khiếu nại phức tạp.

Việc phân định thẩm quyền như vậy giúp đảm bảo mọi khiếu nại được giải quyết theo đúng cấp độ, tránh tình trạng chồng chéo hoặc bỏ sót trách nhiệm.

Xem thêm: Theo quy định khiếu nại cảnh sát giao thông ở đâu?

4. Quyền và nghĩa vụ của người khiếu nại trong quá trình giải quyết

Người khiếu nại có quyền được tiếp nhận, giải quyết khiếu nại đúng thẩm quyền, được thông báo tiến độ và kết quả giải quyết, được yêu cầu bồi thường thiệt hại nếu quyết định hành chính sai trái.

Luật Khiếu nại 2011 quy định người khiếu nại phải nộp đơn khiếu nại kèm theo các tài liệu, chứng cứ liên quan trong thời hạn quy định. Luật Quản lý thuế 2025 bổ sung nghĩa vụ của người nộp thuế là phải thực hiện nghĩa vụ thuế trong thời gian chờ giải quyết khiếu nại, trừ trường hợp được hoãn theo quyết định của cơ quan có thẩm quyền.

Nghị định 254/2026/NĐ-CP yêu cầu người khiếu nại cung cấp đầy đủ hóa đơn, chứng từ điện tử để cơ quan thuế đối chiếu. Việc tuân thủ quyền và nghĩa vụ này giúp quá trình giải quyết khiếu nại diễn ra thuận lợi, minh bạch và đạt hiệu quả cao.

5. Câu hỏi thường gặp

Thẩm quyền giải quyết khiếu nại tại cơ quan thuế được phân định như thế nào?

Trả lời: Theo Luật Quản lý thuế 2025 và Luật Khiếu nại 2011, thẩm quyền giải quyết khiếu nại tại cơ quan thuế được phân định theo cấp hành chính. Cơ quan thuế cơ sở giải quyết khiếu nại lần đầu đối với quyết định do mình ban hành, Cục Thuế giải quyết lần hai hoặc khiếu nại đối với quyết định của Cơ quan thuế cơ sở, còn Tổng cục Thuế giải quyết khiếu nại lần hai đối với quyết định của Cục Thuế. Việc phân định này đảm bảo tính khách quan và tuân thủ quy định pháp luật.

Thời hạn giải quyết khiếu nại tại cơ quan thuế là bao lâu?

Trả lời: Luật Khiếu nại 2011 quy định thời hạn giải quyết khiếu nại lần đầu là 30 ngày kể từ ngày thụ lý, có thể gia hạn thêm 10 ngày trong trường hợp phức tạp. Đối với khiếu nại lần hai, thời hạn là 45 ngày. Luật Quản lý thuế 2025 yêu cầu cơ quan thuế phải thông báo kết quả trong thời hạn này để bảo vệ quyền lợi của người nộp thuế.

Người khiếu nại có thể làm gì nếu không đồng ý với kết quả giải quyết?

Trả lời: Nếu không đồng ý với kết quả giải quyết khiếu nại, người khiếu nại có quyền khởi kiện tại Tòa án theo quy định của Luật Khiếu nại 2011. Đồng thời, họ có thể yêu cầu cơ quan thuế cấp trên xem xét lại theo Luật Quản lý thuế 2025. Việc thực hiện đúng thủ tục giúp bảo vệ quyền lợi hợp pháp của người nộp thuế.

Thẩm quyền giải quyết khiếu nại tại cơ quan thuế cần được hiểu rõ để người nộp thuế thực hiện quyền khiếu nại hiệu quả và tuân thủ pháp luật. Để được hỗ trợ chi tiết hơn về các vấn đề liên quan, hãy liên hệ ACC Hà Nội ngay hôm nay để được tư vấn chuyên sâu và giải quyết nhanh chóng.